بررسی فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس actiniaria: actiniidae)anemonia بر اساس توالی dna میتوکندریایی (coi) در خلیج فارس

نویسندگان

حسین ذوالقرنین

hosein zolgharnein صبا حسینی

saba hoseini

چکیده

در این مقاله، فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس (actiniaria: actiniidae) بر اساس توالی d‏na  میتوکندریایی (coi) در خلیج فارس مورد بررسی قرار گرفت. گونه مورد مطالعه در این تحقیق از جزیره لارک واقع در خلیج فارس جمع آوری شد وdna  آن استخراج و قسمتی از ژنcoi  آن (حدود 700 جفت باز) با استفاده از دو پرایمرlco1490  وhco2198  به وسیلهpcr  تکثیر داده شد و محصولpcr  در دستگاه توالی یاب خودکارdna  به وسیله شرکتbioneer  توالی­ یابی گردید. توالی نوکلئیک اسید و پروتئین گرفته شده از ژنcoi  به عنوان یک توالی جدید در ژن بانک گزارش شد. بر طبق این توالی شقایق خلیج فارس به عنوان یک گونه جدید با نامanemonia sp. pg  و شماره ثبتab933643.1  در وب­ گاهncbi  قرار گرفت. هدف از این مطالعه شناسایی مولکولی شقایق خلیج فارس و انجام آنالیز مولکولی روی آن بود. در آنالیز مولکولی توالی قسمتی از ژنcoi  میتوکندریایی گونهanemonia sp. pg  از خلیج فارس با 15 شقایق دریایی دیگر از بانک ژن که از لحاظ توالی ژنتیکی به گونه مورد بررسی نزدیک هستند مقایسه گردید. گونهmetridium senile  به عنوان برون گونه در نظر گرفته شد. بررسی فیلوژنتیکی بر اساس آنالیزneighbor-joining  رابطه خواهری بین گونهanemonia sp. pg   از ایران و گونهanemonia sp. anem  را نشان داد ولی روابط منوفایلتیک بین خانواده های شقایق دریایی را نشان نداد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بررسی فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس Actiniaria: Actiniidae)Anemonia بر اساس توالی DNA میتوکندریایی (COI) در خلیج فارس

در این مقاله، فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس (Actiniaria: Actiniidae) بر اساس توالی D‏NA  میتوکندریایی (COI) در خلیج فارس مورد بررسی قرار گرفت. گونه مورد مطالعه در این تحقیق از جزیره لارک واقع در خلیج فارس جمع آوری شد وDNA  آن استخراج و قسمتی از ژنCOI  آن (حدود 700 جفت باز) با استفاده از دو پرایمرLCO1490  وHCO2198  به وسیلهPCR  تکثیر داده شد و محصولPCR  در دستگاه توالی یاب خودکارDNA  به وسیله...

متن کامل

بررسی فیلوژنی مولکولی جنس Linaria Mill. (Plantaginaceae) در ایران براساس توالی DNA کلروپلاستی

سابقه و هدف: جنس Linaria Mill. متعلق به خانواده Plantaginaceae از راسته Lamiales است. زیستگاه این جنس در نیمکره شمالی و در برخی نقاط ایران می باشد. هدف این تحقیق بررسی وضعیت تاکسونومی و یافتن روابط فیلوژنی این جنس در ایران می باشد. مواد و روش ها: مطالعات مولکولی مطابق با روش زیر انجام گرفت: 1- استخراج DNA کامل از برگ ها، 2- تکثیر و تعیین ترادف قطعه ناحیه rpl32-trnL از ژنوم کلروپلاستی،3- انجام...

متن کامل

فیلوژنی مولکولی جنس Eumeces Wiegmann, 1834 (خزندگان: سینسیده) در ایران، براساس DNA میتوکندریایی ژن 16S

Phylogenetic relationships among the Eumeces schneiderii princeps and Eumeces schneiderii pavimentatus investigated using 509 bp partial sequences of 16S mitochondrial gene. Analyses were done by maximum-likelihood (RAxML) criteria on 52 specimens from over 20 geographically distinct localities. Our molecular results proposed two well-supported major clades by their phylogenetic positions, gene...

متن کامل

فیلوژنی مولکولی جنس ( Rochelia (Boraginaceae بر اساس توالی های nrDNA ITS و cpDNA trnL-F

تعداد 8 گونه از جنس Rochelia  و دو گونه از  Lappula (به عنوان برون گروه) با استفاده از توالی هسته‌ای ITS و توالی کلروپلاستی trnL-F به طور جداگانه و نیز به صورت ترکیبی آنالیز شدند. برای مشخص کردن روند تکامل صفات مورفولوژیکی، شش صفت تشخیصی بر روی درخت ترکیبی با استفاده از برنامه MacClade 4 نشان داده شد. آنالیز ها آشکار کرد که بخشه Rochelia به دلیل قرار گرفتن بخشه مونوتیپیک Cryptocarpa (Rochelia c...

متن کامل

تنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی 16S rRNA

میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونه‌های میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمع‌آوری شدند و برای توالی‌یابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینه‌سازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالی‌یابی ژن 16S rRNA که شامل 486 باز هم...

متن کامل

شناسایی مولکولی و فیلوژنی گونه‌های جنس Nerita در سواحل صخره‌ای شمال خلیج فارس

در این پژوهش شناسایی مولکولی گونه­های جنس Nerita، شامل N. lognii، N. albicilla و N. polita، در سواحل شمالی خلیج­فارس به همراه بررسی مورفولوژیک آن­ها انجام شد. این جنس متعلق به خانواده Neritidae بوده و از گونه­های غالب شکم­پایان سواحل صخره­ای می­باشد. نمونه­برداری در سال­های 92 و 93 در سواحل صخره­ای صورت گرفت. نمونه­ها مورد شناسایی مورفولوژیک قرار گرفتند و سپس مراحل استخراج DNA (با استفاده از پو...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
اقیانوس شناسی

جلد ۶، شماره ۲۴، صفحات ۷۷-۸۳

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023